廉政署指出，
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，各部會的預算員額數據來自行政院的預算書，
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，但從未發佈新聞指「教育部最貪」，
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，媒體以此為題與事實不符，
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，但對統計數據不夠精準引發的誤會，
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，表達遺憾和歉意；未來在提出相關預算員額數報告前，
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，將請各部會提供正確人數，
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，並全面檢討過去做成的報告數據，
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，對起訴人數的層級或隸屬單位進一步細分。
廉政署昨晚發新聞稿，指中央各部會、各地方政府公務員「貪瀆起訴案件的案件數和人次」，是根據法務部統計各地檢署起訴的案件數，其中「預算員額數」的部分，是以各單位公布一○一年機關預算員額數為基準，而「相對百分比」是廉政署首次以「機關預算員額數」作為基準所計算。
廉政署表示，教育部被起訴一百零九人次是來自法務部的統計數據，他們再依行政院預算員額數為基準，計算起訴比率是百分之六點三一，這種計算方式是錯誤的。
廉政署長朱坤茂表示，廉政署和各單位曾共同召開兩次會前會，各項統計數據事前就已送到包含教育部等單位，「但沒有人說數據不對，有的話應事先通知，讓他們修改。」
朱坤茂說，廉政署確實應該負較大的責任，但如按照教育部稱全國各級公立學校的十九萬教育人員為基準，去計算起訴比率，分母越大、所得的百分比率就越低；部長曾勇夫已指示將盡速召集各機關檢討計算方式。，