針對兩岸協議監督機制，
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，民進黨團與民間團體均提出自己的版本，
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，其中民進黨版要求立委可參加協議談判，
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，且可交由公民投票複決。
民進黨團提案版本名稱為「台灣與中國締結協議處理條例草案」，
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，行政院長應在協議前向立法院報告，
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，協議內容除應獲得立院同意，
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，立委也可參加協議談判，
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，事後並由立院審議通過，
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，還須交由公民投票複決。另外，
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，立院可對協議內容提出修正。
另外，民進黨立委尤美女也代民間團體提案，將「兩岸協定締結條例草案」送入立院議事處。民間版本重點包括行政部門在談判前須向立院報告，並納入產業及利害關係團體的意見，舉辦公聽會，簽署後須由立院審議通過且可修正，甚至退回協定條文等。
不過，由於民進黨團版條文名稱明定「台灣與中國」，有違政府兩岸不屬於國與國關係的政策，因此朝野對法案名稱就有根本歧異；相對地，前副總統蕭萬長擔任閣揆時提出的「台灣地區與大陸地區訂定協議處理條例草案」，也是基於相同理由而無法通過。，